มะละกอมีจำนวนยีนหลายชุดด้วยกัน ซึ่งนั้นทำให้มะละกอมีรสชาติหวานและเปี่ยมไปด้วยคุณค่า นักวิจัยได้ทำการศึกษามะละกอเพื่อดูว่าพืชมีดอกมีกระบวนการวิวัฒนาการอย่างไร และมะละกอก็ได้เปิดเผยความลับนั้นแล้ว

งานวิจัยนี้ตีพิมพ์ลงวารสารชื่อดัง Nature ซึ่งงานวิจัยนี้เป็นการทำแผนที่จีโนมทั้งหมดของมะละกอพันธุ์ SunUp ซึ่งเป็นพันธุ์ที่ดัดแปลงพันธุกรรมให้ทนต่อไวรัส โดยงานวิจัยระบุว่ามะละกอมีจำนวนยีน น้อยกว่าพืชอย่าง Arabidopsis ที่ทางการวิทยาศาสตร์ใช้เป็นต้นแบบ แต่มะละกอกลับมีความยาวของลำดับดีเอ็นเอมากกว่าพืช Arabidopsis โดยนักวิจัยต่างเชื่อว่า มียีนที่ทำหน้าที่แยกกันไปเช่น ยีนที่เกี่ยวข้องกับการวิวัฒนาการ ยีนที่ทำให้พืชมีรสชาติหวาน หรือมีกลิ่นหอมเพื่อกระจายเมล็ดพันธุ์