นักวิจัยเก็บรวบรวมข้อมูลอันมหาศาลของข้อมูลจีโนม อันหลากหลายด้วยความเร็วที่เพิ่มขึ้นทุกวัน แต่หนทางที่มีประสิทธิภาพในการดูข้อมูลที่ผสมรวมกันนั้นยังขาดความสามารถในการสร้างข้อมูลรวมนั้นขึ้นมา นักวิจัยจากสถาบันบรอดด์ ได้พัฒนา Integrative Genomics Viewer (IGV) ซึ่งเป็นเครื่องมือในการดูข้อมูลที่ใหม่และฟรี ที่จะมาช่วยให้ผู้ใช้รวมและวิเคราะห์ข้อมูลทางจีโนมที่มีความหลากหลายได้อย่างต่อเนื่อง และให้ความยืดหยุ่นในการขยายในช่วงจีโนมที่เฉพาะเจาะจงที่สนใจหรือย่อให้เห็นภาพรวมทั้งหมดได้

เครื่องมือในการดูข้อมูลจีโนมที่รวมกันดังกล่าวเปรียบได้กับ [Google Maps]http://maps.google.com/) มันสามารถรวมข้อมูลทางจีโนมที่ต่างกันมาเป็นข้อมูลชิ้นเดียว ซึ่งนี้จะมีผลกระทบต่อการวิจัยด้านจีโนม ด้วย IGV นักวิจัยสามารถเลือกดูช่วง As, Cs, Ts, และ Gs ซึ่งเป็นเบสของดีเอ็นเอ ที่รวมกันเป็นจีโนม และยังสามารถดูแต่ละชั้นของความซับซ้อนของข้อมูลที่เกี่ยวข้องกับการแสดงออกของยีน เช่นเดียวกับ การเปลี่ยนแปลงของลำดับ หรือการกลายพันธุ์ในระดับรหัสพันธุกรรม และยังมีข้อมูลด้านจีโนมอื่นเช่น ความแปรผันของจำนวนชุดของยีน ข้อมูล chromatin immunoprecipation การดัดแปลงข้อมุลพันธุกรรมที่ถูกส่งต่อ นอกจากนี้ข้อมูลยังสามารถไปวางซ้อนเพื่อคาดการณ์การเปลี่ยนระดับหนึ่งจะมีผลต่ออย่างอื่นอย่างไร ผู้ใช้สามารถเลือกที่จะชมข้อมูลได้หลายแบบ เช่นดูในแบบ แผนที่ความร้อน กราฟจุด หรือรูปแบบอื่นตามที่เลือก เครื่องมือนี้เปิดให้ใช้ทั่วไปและฟรีบนเว็บไซด์

เครื่องมืออื่นให้รายละเอียด มุมมองเฉพาะที่ของข้อมูลจีโนม และเครื่องมือน้อยมากที่แสดงข้อมูลจีโนมทั้งหมด IGV ถูกออกแบบมาให้รวมข้อมูลทั้งหมดและให้การดูที่ย่อขยายบนอัตราส่วนที่ต้องการ

ที่มา - physorg.com

เอกสารอ้างอิง - IGV